丙型肝炎病毒（HCV）主要通過大量或反復的經皮注射傳播（如靜脈藥癮者針頭被病毒污染），血液、血制品、器官移植傳播（1992年以后罕見），醫療機構工作人員被針刺誤傷，以及母嬰傳播。不常見的傳播途徑有：性傳播；與丙肝患者共用個人物品，如剃須刀或牙刷；其他侵入性醫療操作。丙型肝炎病毒感染的高危人群有靜脈吸毒成癮者；1987年以前接受凝血因子治療者；1992年以前接受輸血和實體器官移植者；長期血液透析；職業暴露，如醫護人員被針頭誤傷，而針頭有丙肝患者的血液污染；HIV感染者；丙肝母親的下一代。丙型肝炎病毒感染中有75%-85%發展為慢性感染；60%-70%發展為慢性肝炎；5%-20%在20-30年后形成肝硬化；1%-5%最終因肝癌或肝硬化死亡。
 
應該接受丙型肝炎病毒感染篩查的人有1945-1965年出生的人；靜脈吸毒者，哪怕是在多年前只靜脈吸毒一次者；1987年以前輸注過凝血因子者；1992年7月以前接受過輸血或實體器官移植者；長期接受血液透析的患者；職業暴露，如醫護人員被針刺誤傷；所有HIV感染者；有肝病臨床表現者（例如轉氨酶升高）；丙肝母親所生下一代（為避免母體抗體的混淆，18月齡前不篩查）。
 
丙型肝炎病毒感染的篩查試驗有丙肝抗體檢測，有酶免疫測定法和增強化學發光免疫分析法，確診試驗有HCV定性和定量檢測（PCR)。HCV在暴露后4-10周，可測到丙肝抗體（酶免疫測定法）；暴露6個月后，超過97%的人仍可檢測到丙肝抗體；最早于暴露后2-3周，可檢測到HCV RNA。


 
大多數慢性感染者是無癥狀的，但病情可持續發展，從輕度到重度，甚至發展為肝硬化或肝癌。病情發展呈隱匿性，在幾十年的進展惡化過程中可無癥狀和體征。事實上，很多無癥狀HCV感染者只是在常規檢查中，當發現丙型肝炎病毒檢查的陽性結果或轉氨酶升高時才被發現。
 
丙型肝炎病毒至少有6個基因型，50個亞型。在治療前基因檢測是必須的，因為基因檢測有助于了解丙肝感染的流行病學，并確定治療方案。基因型確定后不用再復查，因為在整個感染過程中病毒基因型不會改變。慢性HCV感染并不僅局限于肝損傷，還可引起其他疾病，被認為與免疫反應有關。HCV感染者糖尿病的發生率增加3倍，可引起腎小球腎炎、混合性冷球蛋白血癥、遲發性卟啉癥、非霍奇金淋巴瘤發生率增加。自2011年以來，隨著高效HCV蛋白酶抑制劑的研發成功，慢性丙肝的抗病毒治療取得了突飛猛進的發展，治愈丙肝已成為可能。